Flüt bakımı karmaşık değildir; birkaç basit alışkanlık çalgının ayarını uzun süre korur ve servis ihtiyacını azaltır.
Birinci alışkanlık kurulamadır. Üfleme sırasında borunun içinde nem birikir; bu nem pedler tarafından emildiğinde pedler sertleşir ve deforme olur. Her çalışma sonrasında temizleme çubuğuna sarılan yumuşak bir bez borudan geçirilmelidir. Üç parça ayrı ayrı kurulanır.
İkinci alışkanlık dudak plakasının silinmesidir. Cilt yağı ve nem metal yüzeyde iz bırakır; kuru ve yumuşak bir bez yeterlidir.
Üçüncü alışkanlık pedlerin kurutulmasıdır. Belirli bir anahtarda ıslaklık sesi duyuluyorsa, ped ile delik arasına ince bir emici kağıt konur ve anahtar birkaç kez hafifçe kapatılıp açılır. Kağıt çekilerek çıkarılmaz; bastırılarak nem alınır.
Dördüncü alışkanlık saklamadır. Çalgı kutusunda ve kuru bir ortamda saklanır. Aşırı sıcak ya da nemli ortamlar pedleri ve ahşap parçaları etkiler.
Beşinci alışkanlık birleştirme dikkatidir. Parçalar birleştirilirken anahtarlara bastırılmamalıdır; zorlanan mekanizma eğilir.
Kaçınılması gerekenler de vardır: kimyasal temizleyiciler, aşındırıcı parlatıcılar ve mekanizmaya rastgele yağ uygulanması. Yağlama teknik servis işidir.
Derslerimizde bakım rutini kursiyere ilk derslerde öğretilir ve düzenli olarak hatırlatılır.